Desarrollo de un método analítico para estudiar la metilación del promotor del gen Atxn2

Abstract

La Ataxia Espinocerebelosa tipo 2 -SCA2- es una enfermedad neurodegenerativa y hereditaria, relacionada etiológicamente con la expansión del número de repeticiones del trinucleótido CAG en el gen Atxn2. La SCA2 en Holguín, Cuba, se caracteriza por exhibir la más alta tasa de prevalencia a nivel mundial. Ello y la inexistencia de un tratamiento curativo o algún paliativo, han conducido al estudio de la enfermedad desde diversos enfoques con el fin de encontrar posibles dianas terapéuticas. En este sentido, demostrar si el método analítico “reacción en cadena de la polimerasa sensible a metilación” (MSP, por sus siglas en inglés) es útil para analizar el patrón de metilación del promotor del gen Atxn2, es una necesidad para futuras investigaciones. Como resultado del trabajo se estandarizaron dos variantes analíticas de la MSP para la SCA2; evidenciándose una alta sensibilidad de la técnica desarrollada. Particularmente, empleando oligonucleótidos diseñados para estudiar secuencias hipermetiladas, el límite inferior de detección se alcanza alrededor de las 10 genocopias. Se demostró que en el gen Atxn2 la región núcleo del promotor enmarca 250 pb, está embebida en un típico islote CpG y es susceptible al reconocimiento por factores transcripcionales como Sp1. El uso de la MSP desarrollada y utilizada para investigar el estado de metilación de la región promotora del gen Atxn2 fue efectiva para demostrar cualitativamente que el estado de metilación pudiera afectar la expresión del gen y el fenotipo clínico de la enfermedad.